福建吊笼养殖仿刺参肠道菌群结构分析

摘要: 该研究基于Mi Seq高通量测序技术对福建霞浦海域海上吊笼养殖仿刺参（Apostichopus japonicus）肠道菌落结构进行分析。结果表明,仿刺参前肠（2H₁）、中肠（2H₂）和后肠（2H₃）测得的分类操作单元（OTUs）分别为124、116和78。3个组织样品菌群的物种丰度和优势菌种存在较大差别,其中前肠的物种丰度最高,为2.38,中肠其次,为2.22,后肠最低,为1.24。优势菌群方面,后肠的优势菌群为Formosa和乳球菌属（Lactococcus）（分别占细菌总数的87.38%和7.74%）,而前肠和中肠的优势菌群均是乳球菌属和芽孢杆菌属（Bacillus）,两者分别占前肠中细菌总数的59.68%和11.8%,在中肠中的占比分别为62.45%和12.07%。在重复性方面,后肠中发现的细菌在前肠和中肠中都有发现,而前肠和中肠分别发现6个和4个特有菌群。