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江豚线粒体Cytb和D-loop片段的序列分析及其分子系统学研究

孙希福 高天翔 窦存银 汤哲斌 刘军

孙希福, 高天翔, 窦存银, 汤哲斌, 刘军. 江豚线粒体Cytb和D-loop片段的序列分析及其分子系统学研究[J]. 南方水产科学, 2009, 5(5): 24-31. doi: 10.3969/j.issn.1673-2227.2009.05.005
引用本文: 孙希福, 高天翔, 窦存银, 汤哲斌, 刘军. 江豚线粒体Cytb和D-loop片段的序列分析及其分子系统学研究[J]. 南方水产科学, 2009, 5(5): 24-31. doi: 10.3969/j.issn.1673-2227.2009.05.005
SUN Xifu, GAO Tianxiang, DOU Cunyin, TANG Zhebin, LIU Jun. Sequence analysis of mitochondral Cyt b gene, D-loop and molecular phylogeny of Neophocaena phocaenoides[J]. South China Fisheries Science, 2009, 5(5): 24-31. doi: 10.3969/j.issn.1673-2227.2009.05.005
Citation: SUN Xifu, GAO Tianxiang, DOU Cunyin, TANG Zhebin, LIU Jun. Sequence analysis of mitochondral Cyt b gene, D-loop and molecular phylogeny of Neophocaena phocaenoides[J]. South China Fisheries Science, 2009, 5(5): 24-31. doi: 10.3969/j.issn.1673-2227.2009.05.005

江豚线粒体Cytb和D-loop片段的序列分析及其分子系统学研究

doi: 10.3969/j.issn.1673-2227.2009.05.005
基金项目: 国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2005CB422306)
详细信息
    作者简介:

    孙希福(1982-),男,硕士研究生,从事渔业资源生物学研究。E-mail:sxf19811209@yahoo.com.cn

    通讯作者:

    高天翔,E-mail:gaozhang@ouc.edu.cn

Sequence analysis of mitochondral Cyt b gene, D-loop and molecular phylogeny of Neophocaena phocaenoides

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    Corresponding author: GAO Tianxiang, E-mail:gaozhang@ouc.edu.cn
  • 摘要: 对江豚(Neophocaena phocaenoides) mtDNA的Cyt b(377 bp)和D-loop(343 bp)片段进行了测序和分析,并与GenBank中鼠豚类及一角鲸类同源序列进行了比较。研究结果表明,Cyt b基因片段的碱基组成平均为T:29.0%,C:28.8%,A:27.2%,G:15.0%;D-loop片段的碱基组成平均为T:35.9%,C:21.8%,A:32.4%,G:9.9%。Cyt b基因片段共出现109个变异位点,简约信息位点107个,序列变异度为28.9%,碱基替代主要发生在密码子第3位点上,转换/颠换为13.3;D-loop片段共有109个变异位点,简约信息位点100个,序列变异度为31.8%,转换/颠换为2.4。构建的系统发育树显示,江豚是鼠豚科中较早分化出来的一个类群,与一角鲸科的亲缘关系最近。2个片段序列的分析结果一致,棘鳍鼠海豚Phocoena spinipinnis、太平洋鼠海豚P. sinus和黑眶鼠海豚Australophocaena dioptrica聚为一支。
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出版历程
  • 收稿日期:  2009-02-03
  • 修回日期:  2009-04-24
  • 刊出日期:  2009-10-05

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