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基于DNA条形码的江门近岸海域春季鱼卵的种类鉴定及其形态

陈静 黄德练 王雪辉 徐磊 张健 李亚芳 宁加佳 王亮根 刘双双 林昭进 杜飞雁

陈静, 黄德练, 王雪辉, 徐磊, 张健, 李亚芳, 宁加佳, 王亮根, 刘双双, 林昭进, 杜飞雁. 基于DNA条形码的江门近岸海域春季鱼卵的种类鉴定及其形态[J]. 南方水产科学, 2022, 18(6): 10-18. doi: 10.12131/20220028
引用本文: 陈静, 黄德练, 王雪辉, 徐磊, 张健, 李亚芳, 宁加佳, 王亮根, 刘双双, 林昭进, 杜飞雁. 基于DNA条形码的江门近岸海域春季鱼卵的种类鉴定及其形态[J]. 南方水产科学, 2022, 18(6): 10-18. doi: 10.12131/20220028
CHEN Jing, HUANG Delian, WANG Xuehui, XU Lei, ZHANG Jian, LI Yafang, NING Jiajia, WANG Lianggen, LIU Shuangshuang, LIN Zhaojin, DU Feiyan. Species identification and morphology of fish eggs from Jiangmen coastal waters in spring using DNA barcoding[J]. South China Fisheries Science, 2022, 18(6): 10-18. doi: 10.12131/20220028
Citation: CHEN Jing, HUANG Delian, WANG Xuehui, XU Lei, ZHANG Jian, LI Yafang, NING Jiajia, WANG Lianggen, LIU Shuangshuang, LIN Zhaojin, DU Feiyan. Species identification and morphology of fish eggs from Jiangmen coastal waters in spring using DNA barcoding[J]. South China Fisheries Science, 2022, 18(6): 10-18. doi: 10.12131/20220028

基于DNA条形码的江门近岸海域春季鱼卵的种类鉴定及其形态

doi: 10.12131/20220028
基金项目: 科技基础资源调查专项 (2018FY100105);中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助 (2018YB04)
详细信息
    作者简介:

    陈静:陈 静 (1997—),女,硕士研究生,研究方向为海洋鱼类早期生活史。E-mail: 2455972129@qq.com

    通讯作者:

    杜飞雁 (1974—),女,研究员,博士,研究方向为海洋生态学。E-mail: feiyanegg@163.com

  • 中图分类号: S 932.4

Species identification and morphology of fish eggs from Jiangmen coastal waters in spring using DNA barcoding

  • 摘要: 江门位于珠江口西南部,其近海海域是多种小型鱼类的产卵场和育幼场。以珠江口江门海域春季采集到的鱼卵为研究对象,基于DNA条形码技术分析鉴定了鱼卵种类,描述了鱼卵的形态特征,并初步研究了其形态分类。共采获13种鱼卵,分属于3目10科,其中4种鉴定至种水平,分别为眶棘双边鱼 (Ambassis gymnocephalus)、缘边银鲈 (Gerres limbatus)、多鳞 (Sillago sihama) 和斑头舌鳎 (Cynoglossus puncticeps);8种鉴定至属水平,分别为沙丁鱼属、小公鱼属、棘鲷属、副叶鲹属、叫姑鱼属、属和舌鳎属;1种鉴定至科水平,为鲾科。结果发现,江门海域大部分鱼卵可通过形状与大小、卵周隙宽窄、油球数量和色素分布等形态特征进行分类;对于胚体发育良好的鱼卵,胚体上色素胞颜色、数量及分布也是种类鉴定的重要依据。然而相近种类难以通过单一发育阶段形态特征进行准确区分,更深入的形态学研究尚待开展。
  • 图  1  基于COI基因构建的NJ进化树

    注:节点上数字显示 1 000 次重复的 bootstrap 验证分析中大于 50% 支持率,EGG 表示鱼卵,FISH 表示成鱼。

    Figure  1.  NJ tree based on analysis of COI gene data of egg species

    Note: Higher than 50% bootstrap value in 1 000 replications are shown on the branches. EGG indicates fish eggs, and FISH indicates adult fish.

    图  2  珠江口江门海域 13种鱼卵不同发育阶段的图像

    注:a. 小沙丁鱼属;b. 小公鱼属;c. 棘鲷属;d. 副叶鲹属;e. 眶棘双边鱼;f. 缘边银鲈;g. 叫姑鱼属;h. 鲾科;i. 属;j. 多鳞;k. 舌鳎属-1;l. 斑头舌鳎;m. 舌鳎属-2;比例尺均为 0.1 mm。

    Figure  2.  Photographs of different embryonic development stages of fish eggs of 13 species from Jiangmen coastal area of Pearl River Estuary

    Note: a. Sardinella sp.; b. Stolephorus sp.; c. Acanthopagru sp.; d. Alepes sp.; e. A. gymnocephalus; f. G. limbatus; g. Johnius sp.; h. Leiognathidae; i. Sillago sp.; j. S. sihama; k. Cynoglossus sp.-1; l. C. puncticeps; m. Cynoglossus sp.-2. Scale bar is 0.1 mm.

    表  1  研究海域鱼卵DNA序列对比及物种鉴定结果

    Table  1.   Results of DNA sequence comparison and species identification of fish eggs in survey area

    物种名
    Species
    序列登记号
    GenBank ID
    匹配相似度
    Similarity/%
    匹配种类序列号
    Accession ID
    匹配序列来源
    Source of reference
    沙丁鱼属 Sardinella OM142886—OM142888 99~100 HQ231359、HQ231357、EU595257 菲律宾、中国南海
    小公鱼属 Stolephorus OM142808—OM142840 99~100 MW401810、MT734525、MZ436957 中国东海、南海
    棘鲷属 Acanthopagrus OM142879 99~100 MW379787、OM957527 中国南海
    副叶鲹属 Alepes OM142880 99~100 MN623875、KX254480 印度、中国台湾
    眶棘双边鱼 A. gymnocephalus OM142865—OM142871 99~100 LC569709 中国南海
    缘边银鲈 G. limbatus OM142861—OM142864 100 LC569720 中国南海
    叫姑鱼属 Johnius OM142872—OM142877 99~100 EF607410、OK255542、OK271445 越南、中国台湾
    鲾科 Leiognathidae OM142841—OM142853 99~100 KX254544、LC484871 中国台湾、南海
    属 Sillago OM142854—OM142857 99~100 KY372171、OM048920、MW379766 中国南海
    多鳞 S. sihama OM142878、OM142881—OM142885 100 LC484880 中国南海
    舌鳎属-1 Cynoglossus-1 OM142858—OM142860 99~100 MW041882、EF607349 越南、中国南海
    斑头舌鳎 C. puncticeps OM142889—OM142892 99~100 LC484873 中国南海
    舌鳎属-2 Cynoglossus-2 OM142893 95 JN312935 越南
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出版历程
  • 收稿日期:  2022-01-25
  • 修回日期:  2022-04-18
  • 录用日期:  2022-05-07
  • 网络出版日期:  2022-05-13
  • 刊出日期:  2022-12-05

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