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基于宏条形码技术的南海亮眶灯鱼食性初步分析

陈晓雷 李敏 陈作志 张俊 张帅 齐占会 徐姗楠

陈晓雷, 李敏, 陈作志, 张俊, 张帅, 齐占会, 徐姗楠. 基于宏条形码技术的南海亮眶灯鱼食性初步分析[J]. 南方水产科学. doi: 10.12131/20210199
引用本文: 陈晓雷, 李敏, 陈作志, 张俊, 张帅, 齐占会, 徐姗楠. 基于宏条形码技术的南海亮眶灯鱼食性初步分析[J]. 南方水产科学. doi: 10.12131/20210199
CHEN Xiaolei, LI Min, CHEN Zuozhi, ZHANG Jun, ZHANG Shuai, QI Zhanhui, XU Shannan. Preliminary metabacording dietary analysis of Diaphus Splendidus in South China Sea[J]. South China Fisheries Science. doi: 10.12131/20210199
Citation: CHEN Xiaolei, LI Min, CHEN Zuozhi, ZHANG Jun, ZHANG Shuai, QI Zhanhui, XU Shannan. Preliminary metabacording dietary analysis of Diaphus Splendidus in South China Sea[J]. South China Fisheries Science. doi: 10.12131/20210199

基于宏条形码技术的南海亮眶灯鱼食性初步分析

doi: 10.12131/20210199
基金项目: 国家重点研发计划项目 (2018YFC1406502);广东省基础与应用基础研究重大项目 (2019B030302004-05);南方海洋科学与工程广东省实验室 (广州) 人才团队引进重大专项 (GML2019ZD0605);中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助 (2020TD05, 2021SD01)
详细信息
    作者简介:

    陈晓雷 (1995—),男,硕士研究生,研究方向为水生生物学。E-mail: 1458681743@qq.com

    通讯作者:

    徐姗楠 (1979—),女,研究员,博士,从事海洋生物学研究。E-mail: xushannan@scsfri.ac.cn

  • 中图分类号: S932.4

Preliminary metabacording dietary analysis of Diaphus Splendidus in South China Sea

  • 摘要: 食性研究是鱼类生物学和生态学研究的重要内容,是进行渔业资源开发和管理的基础。该研究以南海亮眶灯鱼 (Diaphus splendidus) 为研究对象,提取其胃含物DNA,选用线粒体基因细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ (mitochondrial cytochrome oxidase subunit Ⅰ, COI) 作为分子标记进行扩增,通过高通量测序鉴定其食物组成。结果显示,亮眶灯鱼胃含物中共鉴定出饵料生物34种,隶属于5门7纲11目18科29属。亮眶灯鱼食物组成包括介形类、桡足类、端足类、鱼类、水母类、磷虾类、翼足类和多毛类。其中介形类、桡足类和端足类是其食物组成中的优势类群,这些优势类群与形态学鉴定方法的结果基本一致,此外还检测出形态学方法未鉴定到的水母这一食物类群。研究表明宏条形码技术适用于南海亮眶灯鱼的食性分析,且比基于形态学的食性分析具有更高的鉴别潜力。
  • 图  2  亮眶灯鱼胃含物相对丰度组成百分比 (纲水平)

    Figure  2.  Relative abundance proportion of diet composition for D. splendidus (class level)

    图  1  南海亮眶灯鱼与其胃含物

    Figure  1.  D. splendidus of South China Sea and its stomach content

    表  1  亮眶灯鱼生物学信息

    Table  1.   Sampling information of D. splendidus

    样品编号
    Sample No.
    体长
    Body length/mm
    体质量
    Body mass/g
    摄食强度
    Feeding intensity
    LK-1582.881
    LK-2471.461
    LK-3562.892
    LK-4532.192
    LK-5542.351
    LK-6481.621
    LK-7471.691
    LK-8380.952
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    表  2  亮眶灯鱼肌肉和胃含物种类鉴定的PCR引物

    Table  2.   PCR primers for species identification and dietary analysis of D. splendidus

    引物
    Primer
    序列 (5'—3')
    Sequence
    退火温度
    Annealing temperature/℃
    片段长度
    Fragment length/bp
    参考文献
    Reference
    FishF1 TCAACCAACCACAAAGACATTGGCAC 55 655 [25]
    FishR1 TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA
    mlCOIintF GGWACWGGWTGAACWGTWTAYCCYCC 62~46 313 [26-27]
    jgHCO2198 TAAACTTCAGGGTGACCAAARAAYCA
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    表  3  亮眶灯鱼胃含物组成

    Table  3.   Diet composition of D. splendidus


    Class
    饵料生物
    Prey species
    相对丰度百分比
    Percentage of abundance/%
    排序
    Rank
    生物类群
    Biome
    甲壳纲 Hexanauplia 瘦乳点水蚤 Pleuromamma gracilis 0.10 20 桡足类
    剑乳点水蚤 Pleuromamma xiphias 0.47 8 桡足类
    腹突乳点水蚤 Pleuromamma abdominalis 0.07 24 桡足类
    美丽长腹水蚤 Metridia venusta 0.13 14 桡足类
    普通波水蚤 Undinula vulgaris 0.28 17 桡足类
    波刺水蚤属 Undeuchaeta sp. 0.41 11 桡足类
    茗荷属 Conchoderma sp. 9.83 2 桡足类
    介形虫纲 Ostracoda 长拟浮萤 Paraconchoecia oblonga 0.09 22 介形类
    猬刺拟浮萤 Paraconchoecia echinata 0.44 10 介形类
    胖海浮萤 Halocypris inflata 77.7 1 介形类
    吸海萤属 Halocypris sp. USNM IZ 1448950 0.06 27 介形类
    双浮萤属 Discoconchoecia sp. S8-D6 0.67 6 介形类
    短刺直浮萤 Orthoconchoecia secernenda 0.11 19 介形类
    刺额葱萤 Porroecia spinirostris 0.04 30 介形类
    软甲纲 Malacostraca 拟遂足磷虾 Thysanopoda aequalis 0.40 12 磷虾类
    武装片戎 Vibilia armata 3.56 3 端足类
    莫氏硬壳寄居蟹 Calcinus morgani 0.07 24 十足类
    辐鳍亚纲 Actinopteri 半裸银斧鱼 Argyropelecus hemigymnus 0.03 31 鱼类
    长银斧鱼 Argyropelecus affinis 0.07 24 鱼类
    勃氏圆罩鱼 Cyclothone braueri 0.10 20 鱼类
    大西洋钻光鱼 Gonostoma atlanticum 0.36 13 鱼类
    离光鱼属 Woodsia sp. 0.03 32 鱼类
    黑须黑巨口鱼 Melanostomias tentaculatus 0.06 27 鱼类
    眶灯鱼属 Diaphus sp. 0.12 18 鱼类
    吕氏眶灯鱼 Diaphus luetkeni 0.08 23 鱼类
    眶暗虹灯鱼 Bolinichthys pyrsobolus 0.05 29 鱼类
    后肛鱼 Opisthoproctus soleatus 0.45 9 鱼类
    望远冬肛鱼 Winteria telescopa 0.59 7 鱼类
    水螅纲 Hydrozoa 棍手水母属 Rhopalonema sp. 0.23 15 水母类
    Botrynema sp. 2.43 4 水母类
    腹足纲 Gastropoda Clio pyramidata 0.78 5 翼足类
    Diacria major 0.01 34 翼足类
    驼龟螺 Cavolinia gibbosa 0.02 33 翼足类
    多毛纲 Polychaeta 叶须虫属 Phyllodoce sp. 11BIOAK-1631 0.16 16 多毛类
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    表  4  南海海域不同灯笼鱼胃含物比较

    Table  4.   Diet composition of myctophidae from the South China Sea and their comparisons

    生物类群
    Biome
    亮眶灯鱼 (本研究)
    D. Splendidus (this study)
    金鼻眶灯鱼[14]
    D. chrysorhynchus
    瓦氏眶灯鱼[15]
    D. watasei
    尾明角灯鱼[31]
    Ceratoscopelus warmingii
    介形类 Ostrac oda
    桡足类 Copepoda
    端足类 Amphipoda
    鱼类 Fish
    磷虾类 Euphausiacea
    腹足类 Gastropod
    十足类 De capoda
    多毛类 Polychaeta
    水母类 Jellyfish
    萤虾类 Lucifer
    等足类 Sopoda
    毛鄂类 Chaetognatha
    头足类 Cephalopoda
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出版历程
  • 收稿日期:  2021-07-19
  • 修回日期:  2021-09-22
  • 网络出版日期:  2021-10-19

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