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研究论文
2020-01期封面+目录
2020, 16(1)
摘要:
黄鳝生长差异基因发掘及其调控机制初步研究
霍欢欢, 刘瑜, 周秋白, 郭枫, 隗黎丽, 彭墨, 张燕萍, 陈文静
2020, 16(1): 1-8. doi: 10.12131/20190176
摘要:
为揭示黄鳝 (Monopterus albus) 生长相关基因的调控机制,对相同亲本具有显著性生长差异的黄鳝肝脏进行了转录组测序分析。结果显示,转录组测序共得到19 149个基因,其中差异基因598个,差异基因中有303个基因显著上调,295个显著下调。KEGG通路分析发现,598个差异基因分属262条通路中,其中有38条通路显著富集。GO功能注释发现,与生长相关的差异基因有7个,分别为col1α1、nkx6.1、nnosplexina4、igfbp1、pcgf1和h3.3,这些基因表达水平的变化可能对黄鳝神经、内分泌和消化系统的发育及生理活动产生了调节作用从而影响了黄鳝的生长。结合KEGG通路分析发现,col1α1所在的利什曼病通路和nnos所在的精氨酸和脯氨酸代谢通路富集显著,说明其对黄鳝生长具有重要调节作用。
副溶血弧菌养殖对虾分离株耐药性及耐药基因分析
魏文娟, 赵姝, 王元, 周俊芳, 李新苍, 房文红
2020, 16(1): 9-16. doi: 10.12131/20190165
摘要:
文章采用琼脂稀释法检测从养殖患病对虾中分离的36株副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)对16种药物的耐药性,并用PCR法检测喹诺酮类耐药基因qnrAqnrBqnrSqnrVC,酰胺醇类耐药基因catoptrAfloRcfr,四环霉素类耐药基因tetAtetBtetM,磺胺类耐药基因sul1、sul2和sul3,氨基糖苷类耐药基因strAstrBaadAaacA,利福霉素类耐药基因arr,β-内酰胺类耐药基因blaCARB和大环内酯类耐药基因erm的携带状况,分析其耐药表型和基因型之间的相关性。结果显示,36株副溶血弧菌对β-内酰胺类药物氨苄西林耐药率最高(88.9%),其次为磺胺类药物磺胺甲噁唑(66.7%),硫酸新霉素、庆大霉素、头孢曲松和美罗培南呈现100%敏感。多重耐药副溶血弧菌比例高达61.1% (22/36),其中1株对6类抗菌药耐药。喹诺酮类耐药基因qnrVC检出率最高达72.2% (26/36);其次为氨基糖苷类耐药基因srtB,检出率58.3% (21/36);大环内酯类、利福霉素类耐药基因均未检测到。耐药基因检出率与耐药表型没有表现出一一对应的关系,提示副溶血弧菌耐药的复杂性。
驼背鲈 () ×蓝身大斑石斑鱼 () 杂交子代发育及生长比较
李振通, 田永胜, 成美玲, 吴玉萍, 张晶晶, 李子奇, 王林娜, 马文辉, 庞尊方, 孙礼娟, 翟介明
2020, 16(1): 17-26. doi: 10.12131/20190168
摘要:
为培育具有优良性状的石斑鱼新品种,利用杂交育种技术开展以驼背鲈(Chromileptes altivelis)为母本、蓝身大斑石斑鱼(Epinephelus tukula)为父本的杂交育种试验。借助人工授精技术,同时以驼背鲈作为对照,利用显微镜 (Nikon E200) 以及解剖镜 (Olympus) 对杂交子代以及驼背鲈的胚胎发育和生长状况进行观察、测量与比较。结果显示,在水温27 ℃、盐度30、pH 8.1,微流水、微充气的条件下,杂交子代受精卵经历24 h 50 min完成胚胎发育,驼背鲈为25 h 8 min。胚后发育经历前期仔鱼 (0~3日龄)、后期仔鱼 (4~40日龄)、稚鱼期 (41~60日龄) 和幼鱼期 (61日龄以后) 4个时期完成变态发育。至330日龄时杂交子代与驼背鲈全长分别为 (23.57±0.94) cm、(18.35±0.72) cm,体质量分别为 (220.5±25.3) g、(142.6±0.58) g,杂交子代生长速度快,全长与体质量分别是驼背鲈的1.28与1.55倍;与驼背鲈在外部形态上相比,杂交子代体型细长,头部较大,体表有无序分布的黑色圆斑纹,各部分鳍小。通过对杂交子代胚胎发育及仔稚幼鱼发育的跟踪观察,发现驼背鲈 (♀)×蓝身大斑石斑鱼 (♂) 远缘杂交组合是可行的,而且杂交子代具有生长速度快的杂交优势,为石斑鱼远缘杂交和石斑鱼新品种的培育提供了科学依据。
室内循环水和池塘养殖四指马鲅的生长性能及形态性状与体质量的相关性研究
李俊伟, 区又君, 温久福, 胡瑞萍, 朱长波, 蓝军南, 李加儿, 周慧
2020, 16(1): 27-35. doi: 10.12131/20190155
摘要:
采用相关性分析和通径分析研究了室内循环水和池塘养殖四指马鲅 (Elentheronema tetradactylum) 的体质量和12个形态性状之间的关系。结果显示,两个养殖群体的形态性状与体质量均呈极显著正相关 (P<0.01),并且两个养殖群体各主要性状间的相关性达到极显著水平 (P<0.01)。与室内循环水养殖群体体质量相关程度较大的形态性状依次为叉长、体长、头长、尾柄高和全长;与池塘养殖群体体质量相关程度较大的形态性状依次为全长、尾柄高、叉长、体长和体高。通径分析表明,体长、体高、头长、体宽和眼径对室内循环水养殖四指马鲅体质量的直接作用达显著水平 (P<0.05),以上形态性状的直接和间接决定系数总和为1.418;全长、尾柄高、体高、躯干长、头长对池塘养殖群体的体质量直接作用均达显著水平 (P<0.05),以上形态性状的直接和间接决定系数总和为0.968。结果表明,池塘养殖环境鱼体的变异系数较大有利于良种选育,而室内循环水养殖规格较均匀利于生产。不同养殖模式下,四指马鲅形态性状与体质量的相关性分析可为其规模化养殖和选育技术优化提供理论依据。
南沙群岛渚碧礁鱼类分类多样性研究
李媛洁, 张俊, 陈作志, 江艳娥, 龚玉艳, 蔡研聪, 杨玉滔
2020, 16(1): 36-41. doi: 10.12131/20190159
摘要:
根据1999—2018年南沙群岛渚碧礁礁栖鱼类流刺网和手钓调查资料,分析了渚碧礁礁栖鱼类物种组成及分类多样性,计算了其平均分类差异指数 (Δ+) 及分类差异变异指数 (Λ+)。结果显示,渚碧礁礁区共记录礁栖鱼类11目43科93属152种,其中鲈形目鱼类占绝对优势 (76%);渚碧礁鱼类的Δ+为58.75,Λ+为102.60。与国内外其他生态系统鱼类群落组成的对比发现,渚碧礁鱼类的Δ+高于赵述岛、米尔恩湾和圣何塞岛,低于东海陆架、南沙群岛西南陆架、北部湾和大亚湾,而Λ+则均低于其他群岛。研究表明渚碧礁鱼类群落物种间的亲缘关系比东海陆架、南沙群岛西南陆架、北部湾和大亚湾更为接近,但比赵述岛、米尔恩湾和圣何塞岛远。物种多样性较高而分类多样性较低是渚碧礁礁栖鱼类多样性分布格局的主要特征。但该礁易受到人类活动的干扰,应及时给予保护。
西江鱼类群落结构和环境影响分析
张迎秋, 黄稻田, 李新辉, 刘乾甫, 李捷, 李跃飞, 杨计平, 朱书礼
2020, 16(1): 42-52. doi: 10.12131/20190142
摘要:
2016—2018年,于珠江干流西江桂平至肇庆6个站点开展了季节性渔获物采集和环境监测,共采集鱼类12目29科99种,单次采集10~45种,香浓威纳指数(H')为0.90~2.93,均匀度指数(J')为0.30~0.89,物种组成为季节和空间的周转格局。相对重要性指数表明,鲮(Cirrhinus molitorella)、广东鲂(Megalobrama terminalis)和赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)为主要优势种。置换多因素方差分析表明鱼类群落时空差异显著,夏—冬季间群落结构差异主要源于鲤(Cyprinus carpio)、鲮、广东鲂和赤眼鳟质量百分比(W%)差异;桂平与梧州、肇庆的显著差异主要源于鲮、广东鲂和银(Squalidus argentatus)的数量百分比(N%)差异,以及鲮、广东鲂、鲤、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)和尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的W%差异。冗余分析分别解释了鱼类N%和W%变异的49.92%和49.61%,主要影响因子为距河口距离、水温、透明度和径流量,且鲮分布在低透明度的高温水域,广东鲂和鲢分布在下游江段,赤眼鳟分布在中上游江段,鲤分布在高透明度的低温水域。
泸沽湖鱼类空间分布特征分析与资源量评估
黄朔, 李连翔, 刀微, 李旭
2020, 16(1): 53-61. doi: 10.12131/20190180
摘要:
2018年8月15—19日,利用Lowrance elite-7 Ti回声探测仪首次对云南省泸沽湖展开鱼类空间分布及资源量评估。调查采用“之”字形航线对泸沽湖全湖进行水声学探测,累计航程42.71 km,基于深度变化值将探测水体分为若干探测单元进行鱼类资源评估,并运用反距离插值法 (IDW) 基于各单元密度绘制进行空间分布图。水声学探测结果表明,泸沽湖鱼类空间分布不均匀,水平方向上,鱼类主要集群分布于近岸环形水域,其中小渔坝附近水域鱼类密度最高,湖心区域鱼类密度最低;垂直方向上,鱼类在表层水域分布较为集中;2018年8月泸沽湖鱼类密度为0.153尾·(1 000 m3)−1,数量24.39万尾,总资源量50.55 t;其中,鲫 (Carassius auratus) 21.17万尾、17.36 t,鲤 (Cyprinus carpio) 1.74万尾、23.01 t,草鱼 (Ctenopharyngodon idellus) 8.63万尾、8.63 t,大鳞副泥鳅 (Paramisgurnus dabryanus) 0.68万尾、1.33 t,小口裂腹鱼 (Schizothorax microstomus) 0.07万尾、0.22 t。此次调查未发现曾出现记录的宁蒗裂腹鱼 (S. ninglangensis) 和厚唇裂腹鱼 (S. labrosus)。
智利外海茎柔鱼角质颚微结构及其年龄与生长研究
刘必林, 刘娜, 李建华, 张鑫浩
2020, 16(1): 62-68. doi: 10.12131/20190116
摘要:
文章利用2010年4—6月智利外海采集的148尾茎柔鱼 (Dosidicus gigas) 样品,分析了茎柔鱼角质颚微结构,并对其年龄和生长进行了研究。结果表明,茎柔鱼角质颚上颚喙部截面由头盖和脊突两部分向前延伸组合而成,周期性生长带明显,每条生长带由明、暗两条生长纹组成,头盖与脊突部的生长纹交汇于内轴成“<”形。标记轮与异常结构的形成与个体发育期的特殊事件以及外界的突发事件有关。根据角质颚生长纹估算茎柔鱼日龄,推测茎柔鱼样本孵化日期为2009年3—11月,主要为6—7月;胴长与角质颚日龄呈显著的幂函数关系,其中雌性茎柔鱼胴长的平均瞬时生长率 (Instantaneous growth rate, IGR) 和绝对生长率 (Absolute daily growth rates, AGR) 分别为0.14 %·d−1和0.60 mm·d−1,雄性茎柔鱼胴长的平均IGR和AGR分别为0.11 %·d−1和0.47 mm·d−1。研究结果为柔鱼类年龄鉴定和生长估算提供了新方法,并为中国开展头足类相关研究奠定了基础。
南太平洋长鳍金枪鱼延绳钓渔获率与环境因子的关系研究
张嘉容, 杨晓明, 戴小杰, 邹莉瑾
2020, 16(1): 69-77. doi: 10.12131/20190178
摘要:
为掌握不同水层的环境因子对长鳍金枪鱼 (Thunnus alalunga) 延绳钓渔获率的影响,根据2015—2017年中国大陆在该海域的长鳍金枪鱼延绳钓渔捞日志资料,结合同期海洋环境数据,采用广义可加模型 (Generalized additive model, GAM) 对渔获率与各因子的关系进行研究。通过相关分析获取各环境因子相关系数,对相关性较大的环境因子分组建模。结果表明:1) 海表面温度与120 m水深温度、海表面温度与海表面高度、120 m水深温度与海表面高度、300 m水深温度与300 m水深盐度为高度相关因子,海表面盐度、叶绿素a浓度、海表风场南北分量与其他环境因子之间的相关性均较小;2) 模型的总解释偏差介于30%~40%,各环境因子重要性依次为120 m水深温度、海表温度、300 m水深温度、120 m水深盐度、海表面高度、300 m水深盐度、海表盐度、混合层深度、海面风场南北分量、海面风场东西分量、叶绿素a浓度;3) 120 m水深温度与单位捕捞努力渔获量 (CPUE) 在15~30 ℃呈负相关。海表温度整体趋势与120 m水深温度类似,其中在25~28 ℃呈正相关。300 m水深温度与CPUE在10~18 ℃呈现明显的正效应关系。
北太平洋亚热带海域大眼金枪鱼秋季摄食习性的初步研究
党莹超, 陈屹林, 戴小杰, 李云凯, 吴峰, 刘攀
2020, 16(1): 78-86. doi: 10.12131/20190184
摘要:
中国金枪鱼延绳钓渔业观察员于2018年9—12月在北太平洋亚热带水域 (150°W—164°W,30°N—37°N) 采集了146尾大眼金枪鱼 (Thunnus obesus) 样品,并对其胃含物组成进行了研究。结果表明,大眼金枪鱼胃含物中共鉴别出36种饵料种类,隶属于28科,优势饵料为帆蜥鱼 (Alepisaurus ferox)、发光柔鱼 (Eucleoteuthis luminosa)、魣蜥鱼 (Lestidium prolixum) 和眶灯鱼 (Diaphus sp.),其相对重要性指数百分比 (IRI%) 分别为25.65%、14.48%、7.56%和6.77%。大眼金枪鱼在叉长为100~110 cm范围内的摄食强度最高,在性腺成熟度Ⅲ期的摄食强度也最高,而Ⅴ期的摄食强度最低,此外,在150~250 m水层中的摄食强度较高。研究结果有助于提高对大眼金枪鱼生物学特征和摄食习性的认识,及进一步了解其在生态系统和食物网结构中所扮演的重要角色。
碳、氮、磷营养对7种海洋微藻种群增长的影响研究
刘祚屹, 綦世斌, 何宁, 寇杰锋, 孙凯峰
2020, 16(1): 87-97. doi: 10.12131/20190089
摘要:
文章采用批次培养方式研究双胞旋沟藻 (Cochlodinium geminatum)、米氏凯伦藻 (Karenia mikimotoi)、中肋骨条藻 (Skeletonema costatum)、牟氏角毛藻 (Chaetoceros muelleri)、球形棕囊藻 (Phaeocystis globosa)、亚心形扁藻 (Platymonas subcordiformis)和眼点拟微绿球藻 (Nannochloropsis oculata) 在不同碳 (C)、氮 (N)、磷 (P)条件下的生长特性,以期为养殖尾水的原位处理筛选优良藻种 (株)。结果表明,这7种微藻的比生长速率与C、N、P浓度总体呈正相关。相较对照组,C对旋沟藻、骨条藻和拟微绿球藻比生长速率的促进作用分别为35%、19%和19%,P对比生长速率的最大促进作用介于25.01%~446.60%,硝酸盐为16.54%~77.52%,铵盐为15.79%~88.82%,尿素为25.16%~71.43%。7种微藻的最大比生长速率与细胞体积总体呈负相关,棕囊藻的比生长速率最高,拟微绿球藻和扁藻最大比生长速率与其他藻华种相比无显著差别。微藻的氮磷吸收速率随细胞体积增加呈升高趋势,单位氮磷利用效率随细胞体积增加呈降低趋势。培养液中P吸收速率显著高于N,氮磷比均呈升高趋势。眼点拟微绿球藻和亚心形扁藻可用于养殖尾水氮磷的快速去除。
亚热带海湾养殖环境综合分级定量评价研究
廖秀丽, 黄洪辉, 齐占会, 戴明, 刘华雪
2020, 16(1): 98-109. doi: 10.12131/20190067
摘要:
根据2011—2012年在南海北部沿岸3个亚热带养殖海湾 (茅尾海、大鹏澳、白沙湾)开展的生态环境调查资料,糅合养殖海域综合分级评价与预警方法及河流综合水质标识指数 (Iwq)评价方法,在划分海域环境等级的基础上定量比较同一级别生态环境的优劣。结果显示,3个海湾共12个航次的调查中,仅2次 (大鹏澳的秋、冬季)环境评级为良好,其余10次均为中等;春季3个海湾评级均为中等且指数相近,夏、秋、冬三季则以白沙湾环境质量状况最差;两年中共有5个水环境因子发生警兆,所调查的3个海湾均存在富营养化的风险;季节更替对海湾环境的影响随着纬度升高而增大。文章发现改进后的Iwq在比较同一级别环境状况的优劣时较有效率,但其在不同级别之间的可比性不确定。
超声波辅助过氧化氢法降解坛紫菜多糖及其抗氧化活性的研究
黄海潮, 王锦旭, 潘创, 杨贤庆, 戚勃, 李来好, 赵永强
2020, 16(1): 110-119. doi: 10.12131/20190220
摘要:
该试验比较了超声波法、过氧化氢法、超声波辅助过氧化氢法降解坛紫菜 (Porphyra haitanensis) 多糖的效果,最后以1,1-二苯基-2-三硝基苯肼 (1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl,DPPH) 自由基清除率为指标,通过单因素和正交试验优化了超声波辅助过氧化氢法降解坛紫菜多糖的工艺。对比了降解前后多糖的抗氧化活性,并分析了其与分子量、结构特征及理化性质等的相关性。结果表明,在过氧化氢体积分数10%、温度65 ℃、超声波辅助2.5 h条件下,该多糖降解前后DPPH自由基清除率的半抑制浓度 (Half maximal inhibitory concentration, IC50) 由9.37 mg·mL−1降为1.71 mg·mL−1;凝胶渗透色谱结果显示分子量由大于670 kD降为235 835 D;傅里叶红外光谱表明多糖特征吸收峰依旧存在;高效液相色谱分析发现单糖组成大致相同,糖醛酸质量分数有所降低;理化性质显示硫酸基质量分数增高,3,6-内醚半乳糖质量分数明显降低。因而超声波辅助过氧化氢法可较好地降解坛紫菜多糖,并可改善理化性质及结构特征进而增强抗氧化活性,为低分子量多糖的制备及构效关系分析提供依据。
研究简报
宽口裂腹鱼消化系统解剖和组织学观察
魏杰, 曹希全, 任永丽, 艾克拜尔·热合曼, 聂竹兰
2020, 16(1): 120-126. doi: 10.12131/20180262
摘要:
该研究采用解剖、石蜡切片和HE染色法对宽口裂腹鱼 (Schizothorax eurystomus) 消化系统解剖特征和组织切片进行观察。结果显示,其消化管管壁由内向外分别为黏膜层、黏膜下层、肌层和浆膜,主要差别在于黏膜层和肌层。食道黏膜上皮为复层扁平上皮,上皮间分布有大量杯状细胞;前肠和中肠黏膜上皮为单层柱状上皮,明显可见刷状缘、杯状细胞和淋巴细胞分布其间;后肠黏膜上皮为假复层柱状上皮,其间也有杯状细胞和淋巴细胞分布,肠道中杯状细胞由前至后逐渐增多。食道肌层为内环外纵的骨骼肌;前肠肌层为内环外纵的平滑肌;中肠和后肠为内螺旋外环行的平滑肌。消化腺由肝脏和胰腺组成,胰腺弥散状分布在肝脏中,肝小叶不明显。研究表明,宽口裂腹鱼消化系统组织学特征与其食性具有适应性。
基于RNA-seq数据的密斑刺鲀SSR分子标记开发及鉴定
马军, 刘嘉鑫, 江智景, 周永森, 于振豪, 王海山, 陈燕, 陈攀, 黄海
2020, 16(1): 127-136. doi: 10.12131/20190147
摘要:
以密斑刺鲀 (Diodon hystrix) 为研究对象,利用RNA-seq技术进行转录组测序及序列组装,最终获得221 762条Unigene序列,N50为2 240 nt,GC含量为46.20%。利用MISA软件从该转录组数据中搜索到106 221个符合条件的SSR位点,分布于62 451条Unigene中,发生频率为28.16%。优势重复单元为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,发生频率分别为48.99%、32.57%和14.72%,其中单核苷酸重复单元中以A/T为主,占总SSR位点数的46.21%,二和三核苷酸重复单元分别以AC/GT和AGG/CCT为主,占比分别为21.90%和2.70%。选取SSR长度大于等于20 bp的位点设计了17 563个位点的引物,随机挑选160对位点引物进行扩增鉴定,筛选到95对有效扩增引物,占比为59.38%。通过多态性验证,最终获得30对稳定、可重复的多态性引物 (占有效扩增引物的31.58%),其中15对引物表现出高多态性 (PIC>0.5),这些高多态性引物具有评估密斑刺鲀群体多样性的潜力。结果表明,密斑刺鲀转录组数据可作为开发稳定的SSR标记的有效来源,该实验所开发的多态性SSR位点为进一步研究密斑刺鲀的遗传图谱和遗传多样性奠定了基础。