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2019, 15(1)
摘要:
研究论文
基于概率模型的长江口鱼类空间共现模式分析
吴建辉, 王家启, 戴小杰, 田思泉, 刘健, 陈锦辉, 王学昉
2019, 15(1): 1-9. doi: 10.12131/20180112
摘要:
根据2012—2014年长江口的渔业资源调查数据,采用概率模型、网络分析方法对长江口鱼类群落物种空间共现模式及影响因素进行综合分析。结果表明,长江口鱼类群落模式主要为物种的随机共现,群落构建中以中性元素的影响占主导地位,环境变化驱动的随机因素对种间共现的影响大于种间相互作用;种间共现模式有显著的季节差异,这种季节差异主要与海洋洄游型鱼类和河口定居型鱼类的季节更替有关;高物种权度和中间中心性种类的季节性更替影响种间共现模式的随机性;棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)对群落内信息交换的控制能力较强,在长江口鱼类群落中处于核心地位。
柘林湾海洋牧场生态系统服务价值评估
马欢, 秦传新, 陈丕茂, 林会洁, 段丁毓
2019, 15(1): 10-19. doi: 10.12131/20180041
摘要:
采用生态系统服务理论,对柘林湾海洋牧场建设前后生态系统服务价值进行了系统评估。在此基础上,运用ArcGIS分析了柘林湾海洋牧场网箱养殖区、海藻增殖区、贝类底播区、人工鱼礁区、增殖放流区等不同功能区生态系统服务价值的空间分布特征。结果表明,2011—2013年,柘林湾生态系统服务价值从海洋牧场建设前的58 613万元上升至建设后的67 370万元。价值构成未发生明显变化,表现为供给服务价值最高,文化服务价值次之,调节服务价值相对较低。柘林湾海洋牧场不同功能区服务功能价值空间分布特征大致为网箱养殖区>海藻增殖区>贝类底播区>人工鱼礁区>增殖放流区。
热带西太平洋帆蜥鱼胃含物组成分析
刘攀, 戴小杰, 王杰, 高春霞, 吴峰, 王学昉
2019, 15(1): 20-30. doi: 10.12131/20180141
摘要:
根据中国金枪鱼延绳钓渔业观察员于2017年9月至2018年1月在热带西太平洋(165°45′E~178°00′W,03°02′S~18°34′S)采集的138尾帆蜥鱼(Alepisaurus ferox)样本,对其胃含物组成进行了研究。结果显示,帆蜥鱼胃含物中共鉴定出61种(类)生物,分属鱼类、软体动物、甲壳类、多毛类、刺胞动物和海樽类等6大类44科。此外,还观察到了同类相食现象以及塑料垃圾。胃含物的Shannon-Wiener多样性指数(H')为2.71,Pielou均匀度指数(J')为0.67,饵料优势指数(D)为0.12。相对重要性指数(IRI)分析结果显示软体动物为帆蜥鱼的主要食物,其IRI为7 573.31,占IRI总和百分比(IRI%)为53.11%。在科一级水平上,褶胸鱼科、帆蜥鱼科、龙骨螺科、翼管螺科、单盘蛸科、爪乌贼科、刺虾科、宽腿鰯科、Eurytheneidae和浮沙蚕科为其优势饵料。
光合细菌菌剂和沼泽红假单胞菌对实验水体氮磷营养盐和微生物群落的影响
信艳杰, 胡晓娟, 曹煜成, 徐煜, 许云娜, 苏浩昌, 徐创文, 文国樑, 李卓佳
2019, 15(1): 31-41. doi: 10.12131/20180144
摘要:
为比较光合细菌菌剂与沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris)的生理生态特性,分析了不同初始菌量的菌剂PG和菌株PSB-1对实验水体氨氮( \begin{document}\small ${\rm NH}^+_4{\text -}{\rm N}$\end{document} )、亚硝氮( \begin{document}$\small {\rm NO}^-_2{\text -}{\rm N}$\end{document} )、硝氮( \begin{document}$\small {{\rm NO}^{-}_{3}}{\text -}{\rm N}$\end{document} )和活性磷( \begin{document}\small ${\rm PO}^{3-}_4$\end{document} -P)的降解效果,通过高通量测序分析了菌剂PG的优势菌组成及实验结束时水体细菌数量和微生物群落组成。结果显示,菌剂PG组对实验水体的 \begin{document}\small ${\rm PO}^{3-}_4$\end{document} -P、 \begin{document}\small$ {\rm NO}^-_3$\end{document} -N和 \begin{document}\small$ {\rm NO}^-_2$\end{document} -N有一定的降解作用,其最大降解率分别为40.98%、28.28%和20.12%。菌株PSB-1组仅对实验水体的 \begin{document}\small ${\rm NO}^-_2{\text -}{\rm N}$\end{document} \begin{document}\small${\rm PO}^{3-}_4{\text -}{\rm P}$\end{document} 有一定的降解效果,其最大降解率分别为14.19%和9.88%。菌剂PG的主要优势菌为红假单胞菌属(Rhodopseudomonas sp.)。实验7 d后实验组水体细菌数量和微生物群落结构发生变化,水体细菌数量增长,形成以异养细菌为优势菌的菌群结构。结果表明光合细菌菌剂PG对水质因子的降解效果优于沼泽红假单胞菌PSB-1,但与报道的高效光合细菌菌株的降解能力存在一定差距。
溶藻弧菌ZJ-T小RNA srvg17985缺失突变株的构建及该小RNA功能的初步分析
邓益琴, 陈偿, 苏友禄, 程长洪, 马红玲, 郭志勋, 冯娟
2019, 15(1): 42-53. doi: 10.12131/20180127
摘要:
利用同源重组技术构建了溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus) ZJ-T小RNA srvg17985的缺失突变株,并比较研究了野生株和srvg17985突变株在LBS中的生长特性、运动性、胞外蛋白酶分泌、对铁的吸收利用、对抗生素的抗性以及生长代谢等生物学特性。结果表明,小RNA srvg17985缺失后不影响溶藻弧菌在LBS中的生长、运动性、胞外蛋白酶分泌、对铁的吸收利用、对抗生素的抗性以及对测定的多数碳源、氮源的代谢;但srvg17985突变株对昆布多糖(laminarin)、果胶(pectin)以及二羟基丙酮(dihydroxyacetone)的利用增强,并转变为可利用丙氨酸-天冬氨酸(Ala-Asp)作为单一氮源。
利用微卫星标记分析7个凡纳滨对虾引进群体子一代的遗传多样性
黄小帅, 徐煜, 胡晓娟, 徐武杰, 苏浩昌, 文国樑, 杨铿, 曹煜成
2019, 15(1): 54-62. doi: 10.12131/20180135
摘要:
为明晰中国凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)引进群体子一代的遗传多样性特征,于广东的3个对虾主产区采集7个养殖群体的种苗样品,其均为国外引进亲虾繁育的子一代。将之分别命名为TH-A1、TH-A2、TH-B、US-C1、US-C2、US-C3和US-C4,以微卫星标记检测其遗传多样性。结果显示,7个群体在12个位点呈现不同程度的多态性,其平均等位基因数(Na)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Ho)和多态信息含量(PIC)分别为3.333~6.167、0.477~0.670、0.370~0.505和0.414~0.623;44个群体位点显著偏离哈迪-温伯格平衡,和文章中He大于Ho的结果对应。聚类分析显示7个群体共分为3支,其中TH-A1为一支,US-C1、US-C2和TH-A2为一支,其余的聚为一支。结果表明此次采集的养殖群体种苗样品存在一定的遗传差异。该结果可为后续挖掘种苗遗传背景与其养殖性能的关联性提供参考。
华贵栉孔扇贝MSTN基因启动子的功能分析
范嗣刚, 赵超, 王鹏飞, 闫路路, 邱丽华
2019, 15(1): 63-68. doi: 10.12131/20180182
摘要:
为了解肌肉生长抑制素myostatin (MSTN)在华贵栉孔扇贝(Chalmys nobilis)闭壳肌肌肉生长和发育过程中所起的负调控作用,对华贵栉孔扇贝的MSTN启动子序列进行了生物信息学分析。结果显示,MSTN启动子序列长1 358 bp,有4个转录起始位点。核心启动子区为–100~–51 bp。有1个TATA-box (–92~–86 bp)和2个E-box等顺式作用元件;潜在的转录因子结合位点有MEF2、MEF3、FoxO、MTBF和MyoD等;启动子区域无CpG岛。成功构建了6个MSTN启动子不同长度片段的荧光素酶表达载体,瞬时转染到293T细胞并进行双荧光素酶报告基因活性检测,表明6个启动子片段均有转录活性,PGL-534的活性最高,其次为PGL-274、PGL-22和PGL-102,最低的为PGL-995。–216~–364区域可能存在负调控基因表达的转录因子结合位点,–364~–825区域可能存在正调控基因表达的转录因子结合位点。
卵形鲳鲹幼鱼对维生素B2的需要量
黄倩倩, 林黑着, 周传朋, 黄忠, 杨育凯, 虞为, 黄小林, 何嘉奇
2019, 15(1): 69-76. doi: 10.12131/20180065
摘要:
为研究卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)幼鱼对饲料中维生素B2的最适需要量,配制维生素B2水平为0 mg·kg–1、4.4 mg·kg–1、6.2 mg·kg–1、8.0 mg·kg–1、11.3 mg·kg–1、15.5 mg·kg–1的6种实验饲料,每种饲料设3个平行,每个平行放25尾初始均质量为(11.63±0.17) g的卵形鲳鲹幼鱼,每日2次饱食,投喂8周。结果显示,4.4 mg·kg–1组幼鱼的增重率、特定生长率均显著高于0 mg·kg–1组(P<0.05),血清中谷草转氨酶、谷丙转氨酶活性显著低于0 mg·kg–1组(P<0.05),但饲料中维生素B2水平对饲料系数、成活率、肝脏维生素B2含量、血清免疫指标、全鱼粗脂肪和粗蛋白、肌肉水分、粗脂肪和灰分均无显著影响(P>0.05);6.2 mg·kg–1组肝脏D-氨基酸氧化酶(D-AAO)活性显著高于0 mg·kg–1组(P<0.05)。折线模型分析显示,卵形鲳鲹获得最佳生长和肝脏D-AAO活力达到最大时对饲料中维生素B2的需要量分别为4.23 mg·kg–1和6.24 mg·kg–1
罗非鱼片微酸性电解水杀菌工艺响应面法优化研究
于福田, 岑剑伟, 李来好, 杨贤庆, 黄卉, 郝淑贤, 魏涯, 赵永强, 林织
2019, 15(1): 77-84. doi: 10.12131/20180164
摘要:
为研究微酸性电解水对新鲜罗非鱼片的杀菌效果,以杀菌对数值为指标,进行单因素和响应面实验,建立各因素与响应值之间的数学模型,确定最佳杀菌条件。结果表明,最佳杀菌条件为有效氯质量浓度35.00 mg·L–1,浸泡时间22 min,料液质量体积比1∶6,在此处理条件下,杀菌对数值为(0.735±0.001) lg (CFU·g–1),杀菌率为(81.59±0.04)%。
5种鲈形目淡水鱼肌肉脂肪酸及磷脂组成的研究
韩迎雪, 林婉玲, 杨少玲, 李来好, 黄卉, 杨贤庆, 王锦旭, 吴燕燕, 翟红蕾, 郝淑贤
2019, 15(1): 85-92. doi: 10.12131/20180184
摘要:
为研究鲈形目淡水鱼在不同科和种间脂肪酸及磷脂组成的差异,该研究以高体革䱨 (Scortum barcoo)、赤鲈(Perca fluviatilis)、梭鲈(Lucioperca lucioperca)、大口黑鲈(Micropterus salmoides)和罗非鱼(Oreochromis mossambicus)为对象,采用气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)、高效液相色谱-蒸发光散射检测(HPLC-ELSD)对以上5种鱼肌肉中的脂肪酸与磷脂进行了分析。结果表明,5种淡水鱼肌肉中共检测出21种脂肪酸,共有的脂肪酸有8种,分别为C14:0,C16:0,C18:0,C16:1,C18:1,C18:2,C20:5和C22:6。多不饱和脂肪酸(PUFA)含量丰富,PUFA含量除高体革䱨为26.81%之外,其他均大于35%。5种淡水鱼肌肉中共检出6种磷脂,分别为磷脂酰乙醇胺(PE)、鞘磷脂(SM)、磷脂酰肌醇(PI)、溶血磷脂酰胆碱(LPC)、磷脂酰丝氨酸(PS)、磷脂酰胆碱(PC)。5种鱼肌肉磷脂中PC含量最高,占据磷脂总量的45.84%~62.55%,PE和PI次之,PS和SM含量相对较少,仅占总磷脂的2.19%~5.27%和2.06%~3.65%。
2015—2017年市售贝类产品中氯霉素的暴露评估
杨宏亮, 黄珂, 李刘冬, 柯常亮, 赵东豪, 刘奇, 莫梦松, 陈洁文
2019, 15(1): 93-99. doi: 10.12131/20180089
摘要:
为调查市售贝类产品中氯霉素的残留状况并对该情况进行暴露评估,2015—2017年采集贝类样品共300个,采用液质法进行检测。将结果运用@risk软件进行蒙特卡罗模拟分析,通过计算膳食摄入量和人群估计暴露量,对所得结果进行暴露边界比(margin of exposure,MOE)评价。结果显示,2015年有33个样品有检出,人群平均暴露的MOE值为15 361,按照加拿大卫生部的评价标准,属于中危害水平。高暴露人群的MOE值为5 208,属于中危害水平。2016年有3个样品有检出,人群平均暴露的MOE值为103 627,属于中危害水平。高暴露人群的MOE值为34 722,属于中危害水平。2017年未检出氯霉素,属于无危害水平。
研究简报
DNA条形码在篮子鱼科鱼类种类鉴定和系统进化分析中的应用
闫亚利, 张楠, 郭华阳, 郭梁, 朱克诚, 刘宝锁, 张殿昌
2019, 15(1): 100-105. doi: 10.12131/20180083
摘要:
为建立篮子鱼科鱼类物种快速鉴定方法,该研究扩增获得了篮子鱼科10种鱼类的46条线粒体COⅠ基因序列,结合从BOLD和GenBank上筛选出的12种27条篮子鱼科COⅠ基因序列,分析篮子鱼科鱼类的COⅠ基因片段序列特征、种间和种内遗传距离及分子系统进化关系。结果表明,19种73条篮子鱼科COⅠ基因序列的平均碱基组成为T:28.9%、C:28.7%、A:24.6%、G:17.8%。G+C的含量(46.5%)低于A+T的含量(53.5%),碱基组成表现出明显的偏倚性;篮子鱼科鱼类的种间平均遗传距离为0.098,是种内平均遗传距离(0.002)的49倍;基于19种篮子鱼科鱼类的COⅠ序列的系统进化分析结果显示,19种篮子鱼中仅单斑篮子鱼(Siganus unimaculatus)和狐篮子鱼(S. vulpinus)聚类在一起,形成1个分支,剩余17种(89.5%)篮子鱼相同种内个体各自聚为一支,形成17个独立的分支。结果表明基于COⅠ基因的DNA条形码技术可应用于篮子鱼科物种鉴定。
基于RNA-Seq高通量测序技术的大口黑鲈转录组分析
黄勇, 龚望宝, 陈海刚, 熊建利, 孙西红
2019, 15(1): 106-112. doi: 10.12131/20180066
摘要:
文章以大口黑鲈(Micropterus salmoides)组织作为研究对象,利用RNA-seq技术进行转录本测序和数据分析,经拼接组装,最终获得35 659条unigenes,序列平均长度738 bp,序列长度中位数 (N50)为1 052 bp。另外从长度分布与GC含量等方面对unigenes进行评估,数据显示测序质量好、可信度高。使用6大数据库 (KOG、Nr、Pfam、Swiss-Prot、GO和KEGG) 注释大口黑鲈转录组unigenes,分别对应有15 832、21 279、14 524、16 973、15 024和11 185条unigenes获得注释。其中,5 617条unigenes在以上所有数据库中同时注释成功,17 253条unigenes至少被一个数据库注释。KEGG分析结果显示,获得注释的11 185条unigenes被划分到267个代谢通路中,参与信号转导通路的unigenes数量最多,共有1 349条(12.06%)。另外还检测到4 030个微卫星 (SSR)位点。通过对大口黑鲈转录组测序,获得了大量的转录组信息,为大口黑鲈的功能基因克隆、基因组学、遗传多样性分析、分子标记开发及遗传改良等研究奠定了基础。
广东鲂性腺发育组织学研究
刘亚秋, 李新辉, 李跃飞, 杨计平, 徐田振
2019, 15(1): 113-118. doi: 10.12131/20180139
摘要:
利用组织学方法,对珠江下游野生广东鲂(Megalobrama terminalis)性腺进行了显微观察和研究,描述了其卵巢、精巢的结构特征以及各类型生殖细胞形态。结果显示,广东鲂属于一次性产卵类型,卵巢发育类型为部分同步型。其卵巢为细线或条状,卵巢发育经历卵原细胞期、单层滤泡细胞期、卵黄泡期、卵黄充满期、成熟期和退化期。卵细胞发生经历3个阶段:卵原细胞、初级卵母细胞和次级卵母细胞;卵巢初级卵母细胞中核仁外排现象出现在第2时相末期至第3时相早期;精巢呈线状或直棒状,精巢为叶状型结构。精细胞发生经历5个阶段:精原细胞、初级精母细胞、次级精母细胞、精子细胞及精子;繁殖季节精子充满于精小叶内,精小囊消失。
综述
蜈蚣藻属生物学与养殖研究进展
陈素文, 冯彬, 李婷, 张博, 朱长波, 杨贤庆
2019, 15(1): 119-123. doi: 10.12131/20180137
摘要:
蚣藻属(Grateloupia)种类多(中国已报道42种),可食用、药用(具有清热解毒、驱虫、抗肿瘤、抗病毒、抗凝血、抗氧化等作用),并可作为提取卡拉胶的工业原料,是有待于养殖和加工开发的经济红藻。文章综述了蜈蚣藻属分类变动、繁殖生物学、生理生态和养殖的研究现状及存在的问题,为蜈蚣藻属增养殖及研究开发利用提供参考。